Thành lập năm 1968, là doanh nghiệp độc lập trực thuộc Bộ Nông nghiệp và Phát triển nông thôn, thực hiện chủ trương của Đảng và Chính phủ về đổi mới cơ chế quản lý doanh nghiệp, tháng 11/2003 Bộ Nông nghiệp và Phát triển nông thôn đã có Quyết định 5029 cổ phần hóa công ty với Vốn điều lệ ban đầu 13,5 tỷ đồng, quy mô kinh doanh chỉ có 50 tỷ đồng doanh thu.
Với sự đổi mới quản trị doanh nghiệp, chiến lược lấy khoa học công nghệ làm nền tảng và động lực nâng cao năng lực cạnh tranh, huy động tối đa các nguồn lực xã hội cùng tham gia phát triển công ty, sau 15 năm cổ phần hóa, Vinaseed đã trở thành tập đoàn nông nghiệp có quy mô và thị phần lớn nhất Việt Nam.
Vinaseed nằm trong Top 10 doanh nghiệp có năng lực quản trị tốt nhất sàn chứng khoán Việt Nam, quản trị tài chính đứng đầu doanh nghiệp ngành trồng trọt, Top 500 doanh nghiệp lớn và tăng trưởng nhanh nhất Việt Nam liên tục 6 năm liền, Top 50 công ty kinh doanh hiệu quả nhất Việt Nam, và là 1 trong 200 công ty có doanh thu dưới 1 tỷ USD tốt nhất châu Á-Thái Bình Dương.